独玉特殊的结构特点和颜色变化极为丰富，这使它与别的玉石较容易区分。同一块独山玉玉料可以同时出现2~3种或者更多的颜色，颜色鲜艳。翠绿色的独山玉粗看像翡翠，如果仔细观察，绿独玉具有粒状结构或溶蚀交代结构，主要矿物有斜长石、翠绿色铬云母，透明度好。翡翠和软玉呈纤维交织结构。
独山玉与翡翠的区别可以从下列几个方面入手：
      (1)绿色独山玉的颜色是由含有细粒的铬云母或含铬绿泥石所引起的，沿小裂隙形成浓绿色短线状，小脉状的色带，并且颜色偏蓝偏灰色，不够鲜艳。
      (2)绿色独山玉的绿色色脉中常见有黑色的色斑(暗色矿物)即使在强光照射下仍显黑色。而绿色翡翠中的黑点通常较少见，而且在强光下显翠绿色。
      (3)具斑杂状色斑的墨绿色独山玉的颜色分布与翡翠不同。
      (4)独山玉虽然粒度细，但由于不同种类矿物的硬度差别大，分布不均匀，所以抛光面往往不平整，抛光质量往往不好，油脂光泽明显。
      (5)查尔斯滤色镜下变红是绿色独山玉与翡翠鉴别的明显特征。
      (6)独山玉的折光率和相对密度也可当作参考性的鉴定特征
      半透明蓝绿色独山玉与高品质的翡翠外观相近，但是翡翠为纤维交织结构与独山玉的粒状结构明显不同，通过折射率值、密度值测试很容易将二者区分。而且此种独玉颜色因含铬云母所致，在查尔斯滤色镜下变红，另外，独山玉绿色偏蓝，常夹有暗色矿物的黑点，这些特征与相似的翡翠亦明显有别。
      白独玉易与外观相似的石英质玉石和软玉中的白玉相混淆，白玉的结构是毡状结构，非常细腻，光泽一般为玻璃-油脂光泽，这些和独山玉很容易区分，石英质玉石虽然也是粒状结构，但它的折射率和比重都明显低于独山玉，所以也很好区分。